发展农业新质生产力是推动城乡融合，实现城乡一体化的关键。高等教育承担着人才培养、科技创新和社会服务的重任，充分发挥高等教育赋能农业新质生产力的作用，对于提升城乡融合水平，促进国家共同富裕具有重要的现实意义。基于30个省市2012-2023年的统计数据，构建固定效应模型，实证检验高等教育对农业新质生产力的影响，并进一步构建中介效应模型和调节效应模型，检验其中的影响机制和路径。结果显示：高等教育对农业新质生产力有显著正向影响，但影响存在显著区域差异性；在高等教育对农业新质生产力的影响中，人口城镇化发挥了较小的中介作用，产业结构升级发挥着正向调节作用。因此，应当优化高等教育体系，提供农业新质生产力发展的强大动能和重要支撑；因地制宜，激发农业新质生产力的特色效应和创新活力；协同发力，促进高等教育赋能农业新质生产力的有效形成和持续发展。