BBNJ协定临时适用可以缓解协定生效机制的滞后性、检视协定内容的合理性，从而应对海洋突发紧急情况，有助于提高国家管辖范围以外区域的海洋治理成效。然而，《维也纳条约法公约》和BBNJ协定有关条约临时适用的规定较为简略，BBNJ协定临时适用的规则供给不足。就BBNJ协定的临时适用而言，临时适用的自主性可能削弱临时适用效果，临时适用终止的灵活性影响国际海洋秩序的稳定性，临时适用的单边性与权利义务的统一性存在矛盾，BBNJ协定与其他相关国际法的关系不够明确。在BBNJ协定的临时适用中，反向规定“不同意临时适用需要另作声明”可以强化临时适用效果，临时适用产生的义务不因临时适用的终止而立即终止，未同意临时适用的缔约方也应当尊重BBNJ协定的临时适用，BBNJ协定应当“优先”其他相关国际法适用。