桑树MaMATE基因家族鉴定与生物信息学分析
【目的】鉴定桑树中MaMATE(Multidrug and toxic compound extrusion, MATE)家族基因,为揭示桑树MaMATE家族基因的功能及筛选优质种质资源奠定基础。【方法】以拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)的MATE家族基因为参考,筛选桑树的MaMATE家族基因,并进行motif分析、多序列比对分析、系统发生分析、蛋白特征分析、亚细胞定位预测。【结果】筛选出MaMATE家族基因48个,命名为MaMATE1~MaMATE48。48个MaMATE基因编码蛋白序列长度为143~603aa;蛋白分子质量为15.63~65.25kDa;含有4~12个跨膜结构域;亚细胞定位预测结果显示,MaMATEs编码蛋白于质膜、液泡或叶绿体等细胞结构。为了解MaMATE家族基因在桑树中的功能提供理论基础。
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中国蚕学会2024年学术年会论文集
2024年
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