家蚕微粒子虫感染家蚕可引发家蚕微粒子病,造成的危害巨大。该病原可经卵垂直传播,在卵及胚体中增殖,有潜力成为研究无脊椎动物先天性感染的模式系统。为了解析先天性感染中家蚕微粒子虫诱发的宿主免疫应答特征,本研究对先天性感染了家蚕微粒子虫的蚕卵和幼虫进行转录组测序,样本采集时间分别为蚕卵孵化1、2、3、5、7、9天(孵化收蚁)以及收蚁后的第二天、第三天。本次测序共获得645.02 Gb的数据,得到了14372个家蚕基因以及4305个家蚕微粒子虫基因的表达信息,分别覆盖宿主与病原编码基因的98.28%和96.52%。8671个家蚕差异表达的基因中,2199个上调表达,6472个下调表达,涉及家蚕免疫、代谢以及生长发育等。分析宿主免疫应答相关基因发现家蚕微粒子虫的先天性感染能够引起家蚕胚胎的免疫应答。家蚕葡聚糖识别蛋白β-GRP 2在蚕卵孵化2天时的转录被下调;在蚕卵孵化5天时,家蚕肽聚糖识别蛋白PGRP-L1的转录呈显著性上调,PGRP-S2的转录呈显著性下调;幼虫期第二天和第三天Toll3-3的转录水平显著上调。抗菌肽Attacin和Cecropin在第9天(幼虫1天)时转录上调,随后在幼虫2、3天时呈下调的趋势;Moricin在幼虫期持续高量转录,可能对抵御病原起重要作用。本研究对于认识家蚕微粒子虫先天性感染引发的宿主免疫应答过程提供了重要数据基础。