农业水价综合改革是深化资源性产品价格改革和自然资源有偿使用制度改革的重要内容。本文系统梳理了我国农业水价综合改革的历程和取得的成效,深入剖析了改革存在的问题和不足,提出了进一步深化改革的对策建议。研究表明,我国农业水价改革可划分为探索、深入试点、全面推进和攻坚克难4个阶段,不同阶段各有侧重,共同推动改革取得重要进展。但是当前改革还存在着进展不平衡、内生动力不足等问题,亟需通过因地制宜推进改革、健全完善水价形成机制、加强典型经验总结宣传等方面持续深化改革。